ChIRP實(shí)驗(yàn)

ChiRP(Chromatin Isolation by RNA Purification )是一種檢測與RNA綁定的DNA和蛋白相互作用的方法。該方法是通過設(shè)計(jì)生物素或鏈霉親和素探針，把目標(biāo)RNA拉下來以后，與其共同作用的DNA染色體片段就會附在到磁珠上，后通過qRT-PCR、測序、免疫印跡法和質(zhì)譜分析等確定目的RNA、DNA和RNA結(jié)合蛋白（RBPs）。

實(shí)驗(yàn)流程：

1.        ChIRP探針設(shè)計(jì)合成

2.        lncRNA復(fù)合物交聯(lián)

3.        超聲打斷

4.        探針雜交

5.        DNA回收純化

6.        測序分析。

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